Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ALPK3Q96L96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALPK3Q96L96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.1 ms