Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK5RAP3Q96JB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK5RAP3Q96JB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP3Q96JB5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms