Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT43Q96FT9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT43Q96FT9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms