Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPRY1Q96DX4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPRY1Q96DX4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPRY1Q96DX4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RSPRY1Q96DX4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms