Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUB2Q96DC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUB2Q96DC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUB2Q96DC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms