Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCC1Q96CN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCC1Q96CN9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
GCC1Q96CN9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms