Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APH1AQ96BI3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APH1AQ96BI3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APH1AQ96BI3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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