Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC8Q96B26 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC8Q96B26 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC8Q96B26 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms