Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC17Q96AE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC17Q96AE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC17Q96AE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms