Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RERGQ96A58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RERGQ96A58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RERGQ96A58 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RERGQ96A58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RERGQ96A58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RERGQ96A58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms