Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF34Q969K3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms