Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NKD2Q969F2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms