Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4Q969E2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP4Q969E2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms