Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP13Q92995 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP13Q92995 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP13Q92995 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP13Q92995 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP13Q92995 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP13Q92995 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP13Q92995 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP13Q92995 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP13Q92995 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP13Q92995 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP13Q92995 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP13Q92995 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP13Q92995 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP13Q92995 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP13Q92995 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP13Q92995 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP13Q92995 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP13Q92995 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP13Q92995 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP13Q92995 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP13Q92995 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP13Q92995 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP13Q92995 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP13Q92995 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP13Q92995 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP13Q92995 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP13Q92995 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP13Q92995 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP13Q92995 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP13Q92995 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP13Q92995 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP13Q92995 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP13Q92995 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP13Q92995 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP13Q92995 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP13Q92995 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP13Q92995 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP13Q92995 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP13Q92995 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP13Q92995 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP13Q92995 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP13Q92995 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP13Q92995 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP13Q92995 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP13Q92995 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP13Q92995 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP13Q92995 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP13Q92995 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP13Q92995 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP13Q92995 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP13Q92995 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP13Q92995 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP13Q92995 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP13Q92995 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP13Q92995 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP13Q92995 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP13Q92995 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP13Q92995 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP13Q92995 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP13Q92995 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms