Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A3Q92570 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A3Q92570 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms