Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPDL3BQ92485 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3BQ92485 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms