Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM4

PDCD6IP, Programmed cell death 6-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6IPQ8WUM4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD6IPQ8WUM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD6IPQ8WUM4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCD6IPQ8WUM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD6IPQ8WUM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD6IPQ8WUM4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD6IPQ8WUM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms