Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RASGRP4Q8TDF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASGRP4Q8TDF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASGRP4Q8TDF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms