Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DDX54Q8TDD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX54Q8TDD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX54Q8TDD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DDX54Q8TDD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms