Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBP-AS1Q8TBR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIRBP-AS1Q8TBR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms