Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms