Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PJA1Q8NG27 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PJA1Q8NG27 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA1Q8NG27 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA1Q8NG27 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms