Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBEAQ8NFP9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBEAQ8NFP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NBEAQ8NFP9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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