Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM229BQ8NBD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms