Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMPERQ8N8U9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms