Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RYBPQ8N488 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms