Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SFRP1Q8N474 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFRP1Q8N474 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP1Q8N474 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms