Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP8Q8N3A8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP8Q8N3A8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP8Q8N3A8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARP8Q8N3A8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP8Q8N3A8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms