Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBARPQ8N350 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CBARPQ8N350 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms