Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00269Q8N2A0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00269Q8N2A0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms