Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT20Q8IY31 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT20Q8IY31 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms