Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC103Q8IW40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC103Q8IW40 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC103Q8IW40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms