Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3FQ8IUX4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3FQ8IUX4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3FQ8IUX4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3FQ8IUX4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms