Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC5Q8IUR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC5Q8IUR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC5Q8IUR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms