Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VPS37DQ86XT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VPS37DQ86XT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
VPS37DQ86XT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms