Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIBP1Q86W92 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP1Q86W92 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIBP1Q86W92 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms