Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP1Q7Z6B7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms