Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF550Q7Z398 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF550Q7Z398 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF550Q7Z398 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms