Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC11Q7Z392 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC11Q7Z392 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC11Q7Z392 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms