Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP9Q7RTR0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP9Q7RTR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP9Q7RTR0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms