Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549LQ6ZVL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIAA1549LQ6ZVL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms