Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
UBR3Q6ZT12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
UBR3Q6ZT12 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBR3Q6ZT12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
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