Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC129Q6ZRS4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC129Q6ZRS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC129Q6ZRS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms