Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCARA5Q6ZMJ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms