Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIG3Q6UXM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG3Q6UXM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG3Q6UXM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms