Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUX4L9Q6RFH8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUX4L9Q6RFH8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUX4L9Q6RFH8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUX4L9Q6RFH8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUX4L9Q6RFH8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUX4L9Q6RFH8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUX4L9Q6RFH8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4L9Q6RFH8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms