Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC11Q6PKC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TXNDC11Q6PKC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms