Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHBDF2Q6PJF5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHBDF2Q6PJF5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms