Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC23A3Q6PIS1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC23A3Q6PIS1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC23A3Q6PIS1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC23A3Q6PIS1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC23A3Q6PIS1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC23A3Q6PIS1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC23A3Q6PIS1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC23A3Q6PIS1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms