Protein–RNA interactions for Protein: Q6P474

PDXDC2P, Putative pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC2PQ6P474 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDXDC2PQ6P474 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDXDC2PQ6P474 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PDXDC2PQ6P474 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDXDC2PQ6P474 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms